Si bien en un comienzo el área tenía un fuerte componente ambiental, con el transcurso del tiempo tomó gran fuerza el estudio de biopelículas microbianas asociadas a reactores de tratamientos de residuos. Esto derivó a que el área de microbiología ambiental comenzara a orientar sus investigaciones hacia temáticas como el área de biopelículas de importancia en agricultura (plantas) y también en el área de la acuicultura.

Este grupo de investigación continúa trabajando en el área ambiental, pero principalmente sus investigaciones se enfocan en el control de la formación de biopelículas. De estos estudios se desprenden proyectos Fondecyt, InnovaChile, CORFO, Capital Semilla y FIA, con énfasis en el objetivo de desarrollar productos basados en extractos microbianos, para el control de bacterias.